Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms