Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC068631.3-201ENST00000538831 225 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL109936.2-201ENST00000605350 650 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
BBS9Q3SYG4 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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