Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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TRIP13Q15645 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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TRIP13Q15645 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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TRIP13Q15645 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TRIP13Q15645 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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