Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RNASE9-209ENST00000557068 2703 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SIX1Q15475 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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