Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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FOXF1Q12946 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
FOXF1Q12946 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
FOXF1Q12946 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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