Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC004672.1-201ENST00000513082 2088 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AIM2-202ENST00000368130 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTFR2-205ENST00000451457 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ACTG2-203ENST00000409731 1413 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AJ009632.1-201ENST00000433588 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL604028.2-201ENST00000437848 788 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC005899.6-201ENST00000620729 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC022743.1-201ENST00000624990 664 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 YES1-201ENST00000314574 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF10-202ENST00000402932 1967 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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