Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 ZMYM6-203ENST00000373333 1473 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 MKL2-209ENST00000574045 3309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 LINC00466-206ENST00000634576 1279 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 FOLH1-213ENST00000533034 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SCAMP3O14828 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms