Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COPS7AQ9UBW8 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms