Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms