Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC096743.1-201ENST00000485172 319 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 TPD52-213ENST00000520527 2638 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 LINC02209-201ENST00000521245 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 TEFM-204ENST00000580840 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 LAMTOR5-AS1-207ENST00000590826 574 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
SMG9Q9H0W8 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 ZNF674-207ENST00000523374 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 CNTN4-201ENST00000397459 2322 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 ZNF793-208ENST00000588578 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC116366.1-201ENST00000443093 3730 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 C9orf131-201ENST00000312292 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 IL24-207ENST00000611909 1621 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 GPM6A-202ENST00000393658 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC009495.3-201ENST00000425688 779 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 RN7SL149P-201ENST00000465197 281 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
SMG9Q9H0W8 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.6 ms