Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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GTF3C6Q969F1 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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GTF3C6Q969F1 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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GTF3C6Q969F1 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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GTF3C6Q969F1 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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GTF3C6Q969F1 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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GTF3C6Q969F1 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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GTF3C6Q969F1 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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GTF3C6Q969F1 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GTF3C6Q969F1 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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