Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RN7SL237P-201ENST00000580912 287 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 BOLA2P1-201ENST00000584794 232 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PRR13P3-201ENST00000603578 376 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 GABRR3-202ENST00000472788 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LIPF-202ENST00000355843 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 OR7A2P-201ENST00000304105 930 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC133569.1-201ENST00000564327 373 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
UBXN4Q92575 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms