Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
IMPG1Q17R60 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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