Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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