Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MBD5-221ENST00000637159 902 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC037450.1-201ENST00000518129 647 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms