Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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TCIRG1Q13488 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TCIRG1Q13488 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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