Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
GRIK2Q13002 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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