Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
FOXF2Q12947 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms