Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SLC10A2Q12908 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SLC10A2Q12908 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SLC10A2Q12908 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SLC10A2Q12908 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
SLC10A2Q12908 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
SLC10A2Q12908 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SLC10A2Q12908 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms