Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC02424-201ENST00000548512 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PCSK1-201ENST00000311106 5086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
BPTFQ12830 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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