Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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GABPAQ06546 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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GABPAQ06546 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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GABPAQ06546 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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GABPAQ06546 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
GABPAQ06546 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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