Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC083902.2-201ENST00000511828 10086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC130365.1-201ENST00000530524 1553 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OPHN1-201ENST00000355520 7879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PIEZO2-202ENST00000383408 9718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 HERC3-202ENST00000402738 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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LAMA3Q16787 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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LAMA3Q16787 MITF-201ENST00000314557 1798 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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LAMA3Q16787 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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LAMA3Q16787 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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LAMA3Q16787 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MIGA1-201ENST00000370791 5288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 APC2-203ENST00000535453 11656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 PDP2-201ENST00000311765 7146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RNF130-207ENST00000522208 9945 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LAMA3Q16787 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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