Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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