Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SYCP1Q15431 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
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SYCP1Q15431 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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SYCP1Q15431 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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SYCP1Q15431 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
SYCP1Q15431 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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