Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC009119.1-202ENST00000567342 543 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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IFT88Q13099 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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IFT88Q13099 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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IFT88Q13099 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
IFT88Q13099 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
IFT88Q13099 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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