Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CR382285.1-202ENST00000604687 547 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 TMEM230-204ENST00000379277 1536 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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RFXAPO00287 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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RFXAPO00287 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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RFXAPO00287 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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RFXAPO00287 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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RFXAPO00287 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 C5orf56-207ENST00000621237 486 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RFXAPO00287 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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