Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 KCND3-AS1-201ENST00000419258 383 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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USP18Q9UMW8 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
USP18Q9UMW8 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 CCRL2-201ENST00000357392 1593 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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USP18Q9UMW8 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
USP18Q9UMW8 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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