Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
COPS7AQ9UBW8 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms