Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
CDKN3Q16667 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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