Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AL138693.1-201ENST00000622219 129 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SIX1Q15475 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SIX1Q15475 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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SIX1Q15475 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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