Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BRD3Q15059 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
BRD3Q15059 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BRD3Q15059 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BRD3Q15059 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BRD3Q15059 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
BRD3Q15059 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
BRD3Q15059 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
BRD3Q15059 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC114488.2-207ENST00000585660 700 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
BRD3Q15059 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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