Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 FAM186A-203ENST00000543096 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NEUROD1Q13562 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms