Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TCOF1Q13428 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TCOF1Q13428 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TCOF1Q13428 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 CASP12-212ENST00000613512 1451 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TCOF1Q13428 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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TCOF1Q13428 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
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TCOF1Q13428 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
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TCOF1Q13428 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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TCOF1Q13428 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TCOF1Q13428 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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