Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC093799.1-201ENST00000452411 499 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC013546.1-201ENST00000523232 564 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RBMY1A3P-201ENST00000382670 1404 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RGS5-215ENST00000439699 1441 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RSPH14-202ENST00000406876 519 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC020983.1-201ENST00000417063 543 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FOXD4Q12950 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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