Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC098614.1-202ENST00000634895 1830 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
RPS29P62273 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
RPS29P62273 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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