Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF595-204ENST00000609518 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC008555.1-201ENST00000561778 2757 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FAM205C-201ENST00000340783 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC007861.1-201ENST00000576671 674 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC103808.6-201ENST00000578035 464 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 FAM205C-203ENST00000603640 1017 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 CYSLTR2-202ENST00000614739 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXA3O43365 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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