Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
EHD3Q9NZN3 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms