Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLIP4Q8N3C7 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLIP4Q8N3C7 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLIP4Q8N3C7 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLIP4Q8N3C7 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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CLIP4Q8N3C7 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CLIP4Q8N3C7 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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