Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GREB1L-201ENST00000269218 5600 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MYO5A-202ENST00000358212 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MYO5A-206ENST00000399233 12220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CLNK-201ENST00000226951 5599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TRAK2-201ENST00000332624 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 UBN1-208ENST00000590769 3530 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 IGSF1-205ENST00000370904 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC011447.6-201ENST00000623510 2598 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TMSB15B-208ENST00000620307 2286 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NFRKB-203ENST00000524794 4351 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NKD1-201ENST00000268459 17105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF197-205ENST00000396058 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PTPRJ-AS1-201ENST00000533964 301 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 NMD3-201ENST00000351193 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
HERC1Q15751 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms