Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PDLIM5-219ENST00000514743 3356 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC074375.1-201ENST00000372993 192 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RPSAP44-201ENST00000406712 884 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RN7SL182P-201ENST00000496499 300 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC090826.1-201ENST00000564109 915 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL136985.2-201ENST00000607372 535 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RPSAP68-201ENST00000625020 438 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ANGPT1-206ENST00000520734 1526 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PDCD1Q15116 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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