Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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CUL1Q13616 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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CUL1Q13616 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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CUL1Q13616 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CUL1Q13616 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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