Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTP4A2Q12974 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms