Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CYP19A1-216ENST00000559878 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CCDC150P1-201ENST00000537123 2215 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC02324-201ENST00000531609 1442 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 EEF1A1P26-201ENST00000458319 1363 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC01184-206ENST00000508878 968 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC026700.1-201ENST00000512074 544 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PPIAL4D-201ENST00000544708 495 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC012291.1-201ENST00000559666 429 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL589743.4-201ENST00000610763 586 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 PPP3CB-AS1-214ENST00000620432 654 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
CHRNEQ04844 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms