Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZNF181-204ENST00000492450 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC092683.1-202ENST00000620023 754 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC159540.2-201ENST00000621110 754 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
HOXD10P28358 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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