Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC026774.2-201ENST00000513990 1098 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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