Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC127024.8-201ENST00000623719 2094 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
ERVV-1B6SEH8 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms