Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
A4GALTQ9NPC4 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms