Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
GTF3C6Q969F1 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
GTF3C6Q969F1 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms