Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CDKN3Q16667 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms