Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
ALCAMQ13740 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms